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Quinze ans ont passé depuis la fin du Melkine, et rien ne se déroule comme prévu. L'affrontement final entre les Fréquences Banquise et Crépuscule voit l'effondrement rapide de cette dernière. Ismaël semble submergé par la furie de son adversaire, incapable de résister à cette Technoprophète qui s'est incrustée dans son cerveau.

A l'écart du conflit entre les Fréquences, les anciens élèves du Melkine essaient de trouver leur place dans l'Univers. Théo et Myriam sont retournés sur Giverne. Ismaël leur rend visite, mais quinze années se sont écoulées et il est à présent à la tête de Crépuscule, la seule Fréquence à pouvoir contrer la Banquise.

Fuyant la Terre, Cal et Guise arrivent sur Vaha, une grande planète bleue. Cal décide d'orienter l'évolution de ses habitants grâce aux extraordinaires capacités de HI, un ordinateur géant. Mais quand HI se rebelle, Cal, rendu vulnérable, doit se fondre dans la population avant de trouver un plan qui lui permettra de récupérer sa base.

Cal, seul survivant après la destruction de la Terre, a fui dans une capsule spatiale. Sur une grande planète bleue, il est recueilli par les Vahussis, un peuple simple et pacifique. Il tente alors un pari improbable, hâter leur évolution en leur évitant les écueils de la violence et de la bêtise qui ont mené l'humanité à sa perte.