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Quinze ans ont passé depuis la fin du Melkine, et rien ne se déroule comme prévu. L'affrontement final entre les Fréquences Banquise et Crépuscule voit l'effondrement rapide de cette dernière. Ismaël semble submergé par la furie de son adversaire, incapable de résister à cette Technoprophète qui s'est incrustée dans son cerveau.

A l'écart du conflit entre les Fréquences, les anciens élèves du Melkine essaient de trouver leur place dans l'Univers. Théo et Myriam sont retournés sur Giverne. Ismaël leur rend visite, mais quinze années se sont écoulées et il est à présent à la tête de Crépuscule, la seule Fréquence à pouvoir contrer la Banquise.

En 2400, 1.643 vaisseaux de colons ont quitté la Terre pour coloniser l'espace. Une fois débarqués sur d'autres planètes et afin de ne jamais abandonner l'espace, un morceau de chaque vaisseau fut prélevé pour construire le Melkine, un navire-école où vivent 2.000 personnes.