Stuart, la petite souris adoptée par la famille Little, fait accueillir parmi les siens Margalo, une demoiselle oiseau pourchassée sans relâche par un faucon. Peu après, Margalo disparaît. Stuart et Snowbell, le chat de la maison, se lancent à sa recherche à travers la ville. Mais attention, Margalo ne leur a pas tout dit...