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Après de longs mois dans la verdure luxuriante d'Aomori, Makoto replonge dans la jungle de la ville le temps d'un petit séjour chez ses parents. L'apprentie sorcière est ravie de retrouver ses amies d'enfances, la discrète Yayoi et l'espiègle Miko. Mais les vacances prennent bien vite un tour plus sérieux lorsque le trio est chargé d'élucider un mystère dans un célèbre temple…

Makoto se rend dans la péninsule de Shimokita afin de rencontrer un célèbre mage capable de lui révéler son signe magique. Mais si ses méthodes sont très rigoureuses, ses inventions ont parfois des résultats.... explosifs ! Tandis qu'Anzu fait la connaissance d'un étrange samouraï, Chinatsu continue à s'entraîner d'arrache-pied pour devenir une sorcière. Mais la magie demande beaucoup de rigueur, sinon gare aux effets indésirables…

À Aomori, les saisons passent et ne se ressemblent pas. Au menu de cet été, une fête de quartier réunissant les habitants des outre-mondes, un dessert glacé haut comme une montagne, le retour de Lapineau, et la vie secrète des adorables mandragores !

Makoto continue de plus belle son apprentissage et son exploration de la région d'Aomori. En vadrouille dans une ville inconnue, sur un escabeau au milieu des pommiers,   ou à la plage face à un curieux animal, elle culpabiliserait presque de s'amuser autant. Mais il n'y a rien de mieux qu'une vie bien remplie pour devenir une bonne sorcière !

L'été suit son cours à Aomori, avec ses barbecues, ses nuits douces… et ses chutes de neige inexpliquées ! Alors que Makoto cherche à en découvrir la cause, elle tombe nez-à-nez avec un curieux personnage. Quelques quiproquos et situations embarrassantes plus loin, l'apprentie sorcière se voit confier sa deuxième mission. Fini le baby-sitting, il s'agit d'enquêter sur de mystérieux phénomènes…

Sur les conseils d'Akane, Makoto et ses cousins décident de se rendre à un café tenu par des sorcières. Mais lorsqu'ils arrivent à l'adresse indiquée, le bâtiment semble à l'abandon... L'établissement est en réalité tenu par une femme aussi mystérieuse que timide. Entre deux visites d'Inukai et de Nao, Makoto fait également la connaissance d'Anzu, une jeune consœur avec laquelle elle part à la rencontre d'un légendaire animal volant. Entre la magie, le jardinage et la cuisine, nos amis n'ont pas le temps de s'ennuyer !

La saison des pluies commence tranquillement à Aomori, mais ne dissuade pas pour autant Makoto et sa famille d'explorer les environs. Au programme  : ricochets, pêche miraculeuse et chasse aux créatures magiques ! La jeune sorcière franchit également une étape importante dans sa formation en se voyant confier sa toute première mission officielle ! Bien que celle-ci s'annonce plutôt simple, Makoto va avoir une petite surprise…

Partie en Chine à la recherche d'un élixir capable de soigner son amie Inukai, Akane se retrouve dans une situation pour le moins périlleuse. Heureusement qu'elle peut compter sur son sens de la débrouillardise ! De son côté, Makoto s'essaie également à la concoction d'un remède qui l'amène à découvrir d'étranges créatures. Mais elle devra rester discrète, car une journaliste particulièrement curieuse semble s'intéresser de près aux étranges événements récemment survenus en ville…

À son entrée au lycée, la jeune Makoto quitte la région de Tokyo pour le nord-est du Japon. Hébergée chez ses cousins Kei et Chinatsu, elle découvre les petits plaisirs d'une vie plus proche de la nature, où le temps semble s'écouler plus doucement. Mais le quotidien à la campagne ne s'annonce pas de tout repos pour autant, car Makoto est aussi une apprentie sorcière un peu étourdie !

Makoto poursuit sa découverte de la campagne d'Aomori, s'initiant à la cueillette des légumes sauvages et à leurs saveurs subtiles. Profitant de la fête des cerisiers en fleurs, elle fait également une bien étrange rencontre. Et tandis qu'Akane donne un nouveau cours de magie, la petite Chinatsu prend une grande décision…

Un matin d'été, Chinatsu a la surprise de voir Lapineau surgir d'un verre d'eau ! Elle l'enrôle, ainsi que Kei et Inukai, dans son projet de recherches pour l'école : fabriquer une fusée avec une bouteille plastique. Mais bien sûr, la magie vient s'en mêler ! Makoto, qui se prépare à rentrer après son séjour à Yokohama en compagnie de ses amies, voit ses plans bouleversés. Une certaine sorcière irresponsable n'aurait-elle pas dépassé les bornes ?