Sora et ses amis parviennent enfin au QG de l'Organisation XIII afin de sauver Kaïri ! Mais celle-ci s'est déjà échappée de sa cellule, grâce à l'aide de Riku, physiquement méconnaissable. Ils partent alors à la rencontre de leur ami, qu'ils trouvent aux prises avec Xigbar. De leur côté, Mickey et Ansem le Sage tâchent d'enrayer la progression de Kingdom Hearts...
Tout le monde se regroupe afin d'assister au concert des Puma Girls. Les Lucky Stars ont finalement réussi à se retrouver, mais les ennuis ne sont pas loin lors de cette troisième nuit de la CélestiaFest...
Branle-bas de combat à Nanatsutake ! Le tournoi inter-villages approche, et avec lui l’épreuve la plus prestigieuse, le relais des générations, où le hameau est toujours bon dernier. Mais cette année, les villageois comptent bien utiliser leur arme secrète en inscrivant Seishû, de gré ou de force...
Hélas, le calligraphe a beau courir comme une véritable fusée, rien ne se passe comme prévu et la victoire n’est pas au rendez-vous. La déprime est de courte durée, car une nouvelle inattendue tombe : voilà que les parents de Seishû débarquent sur l’île !