Le voyage de Ginko se poursuit. Il part à la recherche de Mujika, un mushishi qui a disparu. Il fera la connaissance de Kôrô, un jeune homme à la recherche d'arc-en-ciel, et devra faire face aux Watahiko, des mushi s'introduisant dans le ventre des femmes enceintes et engendrant des champignons humains.