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Après la destruction du collège invisible, Guillaume et ses camarades sont accueillis pour la rentrée scolaire dans les locaux du collège de Pequaure. Mais au collège de Pequaure, personne ne semble avoir pardonné la défaite infligée par le collège invisible...

Alors que les Maîtres architectes reconstruisent le Collège invisible, Guillaume, Capucine, Thomas et Dragounet se retrouvent transportés dans une dimension étrange et hostile.

Mademoiselle Vidaura, professeure d'histoire, veut réformer le mythique Ordre des chevaliers dragons et a sélectionné Guillaume et ses camarades. Entre Thomas qui essaie d'annuler sa malédiction de loup-garou, la mort qui se promène dans les couloirs, les secrets des professeurs qui ressurgissent et Capucine qui craque pour lui, Guillaume est très occupé.

Suite et fin de cet épisode où mademoiselle Visaura envoyait Guillaume et ses camarades éliminés dans le mythique ordre des Chevaliers des dragons.

Guillaume et ses amis du collège invisible ont sauvé le monde. Tout ne s'est pas déroulé comme prévu. Des tyrans diaboliques règnent en maîtres et ont asservi tous les peuples de la planète, qu'ils soient magiques ou non. Seul Guillaume, l'ultime espoir du monde libre, a pu s'échapper.

C'est un matin comme tous les autres pour Guillaume. Il se réveille, comme d'habitude, se brosse les dents, comme d'habitude, se prépare pour une journée au collège, comme d'habitude, mais quelque chose a changé, non, en fait tout a changé. Au collège invisible, les élèves apprennent que la magie, c'est l'art de créer des changements par la seule volonté. Et si un élève a de la volonté, c'est bien Guillaume. Mais c'est bien connu, il n'a aucune rigueur.

Guillaume trouve par hasard une épée dans une poubelle en pensant qu'elle ferait un accessoire utile à son Cosplay des légendaires. Il a raison car il s'agit d'Excalibur et en la retirant, Guillaume devient de fait le roi Arthur de la légende.

Après avoir vaincu le mal absolu, l'heure est venue pour Guillaume de reprendre les cours au collège. Mais une nouvelle menace se profile à l'horizon : la venue de l'inspecteur d'Académie Radovar Sohal qui décidera de la fermeture ou non du collège.

La rencontre inter-collèges se poursuit : le collège Invisible affronte le collège Péquaure. Entre tricheries et combines, les duels s'enchaînent, tandis qu'un évènement inattendu se produit : la Mort a en effet été invoquée et se promène dans les couloirs. Guillaume et Thomas parviennent à l'intercepter et apprennent qu'un élève va mourir, tandis que Merlin prépare son duel contre Adrien.

Guillaume est un cancre. En magie, il ne touche pas une bille. Alors il triche pour etre le premier de la classe. Juste au moment où le petit peuple cherche un nouveau magicien suprême pour le délivrer du mal absolu. Et ils choisissent qui ? Le premier de la classe du collège invisible. Guillaume quoi ! Fallait pas tricher !

Une nouvelle professeure, Mlle Etrange, fait son entrée au collège invisible. Adrien, Guillaume et les autres partent en excursion astrale. Mais Adrien, jaloux de Guillaume, lui fait une plaisanterie qui l'envoie sur une planète inconnue, habitée par des petits hommes velus qui voient en lui le prophète annoncé longtemps auparavant.

Au Collège Invisible, quand Guillaume a un malaise, ça ne présage jamais rien de bon... Il ne se souvient plus de rien. Ses derniers souvenirs remontent à 10 ans. Juste avant la Grande Catastrophe avec des majuscules partout. Guillaume réussira-t-il à résoudre ce mystère ? Et pourquoi tient-il absolument à devenir professeur de magie ? Lui, qui est tout de même le pire des cancres ?

Mais que se passe-t-il avec Capucine ? Elle bave, elle a mal aux genoux et elle a des bouffées de chaleur. Serait-elle la cible d'une attaque magique ? Ou alors, plus globalement le Collège invisible ? Une seule solution pour le savoir, remonter la piste de cette attaque et enquêter au plus près... sauf que le plus près, c'est le XVème. Arrondissement ? Non, siècle... l'an de grâce 1451 exactement... Une nouvelle aventure de Guillaume, de Dragounet et de ses copains qui vous entraînera dans un autre âge assez moyen, surtout pour les magiciens et autres sorciers qui finissent souvent au poteau feu...

Si Guillaume et Thomas trouvaient un trésor ? Ils pourraient s'acheter ce qu'ils veulent ! Faire des cadeaux à leurs amis ! Arrêter de travailler leur magie au Collège invisible ! Enfin, vraiment arrêter de travailler leur magie... Mais si Guillaume et Thomas le trouvaient, vous pensez vraiment que ce serait le trésor dont ils rêvent et que tout se passerait comme prévu ?

Guillaume et ses camarades du Collège invisible vont voir un spectacle de magie ce qui déclenche une cascade de péripéties et une plongée dans le passé.