Grâce aux conseils stratégiques d'Eudyptes, lequel a remonté le temps afin de sauver l'humanité de l'extinction, Akira et ses compagnons parviennent finalement à vaincre la néo-humaine et les bombyx géants qu'elle contrôlait. Mais la menace prend alors une autre forme, rendant plus incertaine encore l'issue du combat…Un chapitre se referme tandis qu'un autre commence avec celle qu'Akira s'est juré de retrouver : Yui !