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San Francisco. Nicolas et Pernelle Flamel doivent sauver la ville des griffes des monstres échappés de l'île d'Alcatraz. Mais même avec le secours des deux plus grands guerriers de l'histoire, la sorcière et le légendaire alchimiste pourront-ils défendre la ville ? Ou serait-ce le début de la fin de la race humaine ?

Les jumeaux viennent d'arriver à San Francisco où ils pensent enfin se reposer lorsque Sophie est enlevée par Aifé des Ombres, la jumelle de Scathach. Josh retourne à la librairie dévastée demander l'aide de Nicolas et Pernelle. Pendant ce temps, Dee, renié par les Ténébreux, est sauvé par son amie Virginia Dare. Il commence à rêver de rallier Josh à sa cause pour l'entraîner à la nécromancie.

A Alcatraz, Machiavel et Billy the Kid suivent le plan des anciens : ils vont lâcher les monstres d'Alcatraz sur la ville de San Francisco ce qui devrait éradiquer la race humaine. A San Francisco, la fin est proche, Josh et Sophie, les jumeaux de la prophétie ont été séparés.

Josh et Sophie savent désormais que le docteur Dee possède le livre qui permet à Nicolas Flamel, le célèbre alchimiste, et sa femme Pernelle de rester en vie. Fuyant une nouvelle attaque de leur ennemi, les jumeaux débarquent à Paris mais se retrouvent vite pris dans les filets d'un autre personnage, Machiavel, et son armée de monstres...

Josh et Sophie savent désormais que le docteur Dee possède le livre qui permet à Nicolas Flamel, le célèbre alchimiste, et sa femme Pernelle de rester en vie. Fuyant une nouvelle attaque de leur ennemi, les jumeaux débarquent à Paris mais se retrouvent vite pris dans les filets d'un autre personnage, Machiavel, et son armée de monstres...

Jash, 16 ans, travaille dans une petite librairie tenue par un couple, Nicolas et Perenelle. Un jour, quatre hommes débarquent et détruisent la boutique au moyen d'étranges pouvoirs. Nicolas riposte, usant lui aussi de la magie, mais il ne parvient pas à empêcher les hommes d'emporter un vieux livre...

Nicolas Flamel et les jumeaux se rendent à Londres où le roi Gilgamesh doit leur enseigner la magie élémentaire de l'eau. De leur côté les Ténébreux ordonnent à Dee et Machiavel de se débarrasser d'eux au plus vite sans quoi ils se verront infliger les pires souffrances. Ils partent alors pour Alcatraz où Pernelle Flamel est retenue prisonnière.

Jash, 16 ans, travaille dans une petite librairie tenue par un couple, Nicolas et Perenelle. Un jour, quatre hommes débarquent et détruisent la boutique au moyen d'étranges pouvoirs. Nicolas riposte, usant lui aussi de la magie, mais il ne parvient pas à empêcher les hommes d'emporter un vieux livre...