La vie avec quatre filles c'est pas facile, pour un papa solo. Mais lorsque ses trois aînées prennent un peu d'indépendance et quittent le nid familial, ce sont soudain de nouveaux soucis qui crépitent autour du pauvre Dad. Sans oublier que Bébérénice et la chienne Mouf lui donnent bien du fil à retordre. Car sa benjamine, qui est elle aussi sur le chemin de l'indépendance (et du pot), nécessite une attention de chaque instant.
Merlin a enfin retrouvé le goût de vivre et souhaite maintenant faire le bonheur des gens. Pour cela, Tom et Léa doivent remplir de nouvelles missions. La première : rencontrer un grand artiste et le convaincre de faire aimer sa musique au plus grand nombre. Les deux enfants utilisent une flûte magique et sont transportés à Vienne, en 1762. Ils arrivent au palais de l'impératrice d'Autriche.
Tom et Léa, à travers leurs aventures, s'immergent dans la vie quotidienne des Egyptiens et décrivent leurs vêtements, leurs métiers, les jeux préférés des enfants, leurs dieux. Ils s'intéressent aussi aux techniques de momification, à la construction des pyramides et aux pharaons les plus célèbres.
Merlin a laissé à Tom et Léa une lettre inquiétante : un sorcier cherche à dérober les secrets de quatre magiciens. Les deux enfants partent à Paris en 1889 où a lieu l'Exposition universelle. Ils cherchent les quatre magiciens et comprennent qu'ils ne sont autres que les inventeurs géniaux du XIXe siècle : T. Edison, A. Bell, L. Pasteur et G. Eiffel.
La fée Morgane envoie Tom et Léa en Amérique, au XVIIe siècle, à la rencontre des premiers pèlerins. A peine arrivé, Tom tombe dans un piège. Heureusement, les pèlerins et l'Indien Squanto s'empressent de le délivrer et accueillent les enfants dans leur colonie. Tom et Léa vont participer à la première fête traditionnelle américaine, Thanksgiving.
Tom et Léa se retrouvent au coeur de la forêt tropicale africaine. A peine sont-ils arrivés que Léa sympathise avec un bébé gorille et joue avec lui, imitant ses mimiques et grimpant aux arbres. En adoptant le langage de ces gentils géants, les deux enfants s'intègrent à la communauté. C'est l'occasion pour Tom de se prêter à l'étude scientifique de ces animaux si intelligents.