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Jin se fait peu à peu à sa nouvelle vie. Son nouvel ami, Katsu Kaishu, l'emmène à Yokohama pour rencontrer des docteurs et discuter médecine occidentale. A son retour, Jin se retrouve confronté à une multitude de patients atteints par une terrible épidémie de choléra. Malgré toutes les précautions qu'il prend pour les soigner, Jin est aussi contaminé.