Josh et Sophie savent désormais que le docteur Dee possède le livre qui permet à Nicolas Flamel, le célèbre alchimiste, et sa femme Pernelle de rester en vie. Fuyant une nouvelle attaque de leur ennemi, les jumeaux débarquent à Paris mais se retrouvent vite pris dans les filets d'un autre personnage, Machiavel, et son armée de monstres...
Nicolas Flamel et les jumeaux se rendent à Londres où le roi Gilgamesh doit leur enseigner la magie élémentaire de l'eau. De leur côté les Ténébreux ordonnent à Dee et Machiavel de se débarrasser d'eux au plus vite sans quoi ils se verront infliger les pires souffrances. Ils partent alors pour Alcatraz où Pernelle Flamel est retenue prisonnière.
Jash, 16 ans, travaille dans une petite librairie tenue par un couple, Nicolas et Perenelle. Un jour, quatre hommes débarquent et détruisent la boutique au moyen d'étranges pouvoirs. Nicolas riposte, usant lui aussi de la magie, mais il ne parvient pas à empêcher les hommes d'emporter un vieux livre...
Mystère et bulles de chewing-gum à la chocolaterie. Archie vient d'hériter de la célèbre usine de confiseries McBudge. À lui les chocolats, les bonbons et surtout les fameux caramels McBudge, savourés dans le monde entier ! Hélas ! Leur recette originale a disparu. Et quelque chose se trame dans l'ombre... Une menace qui risque de lui faire perdre ce fabuleux héritage. Si Archie ne parvient pas à retrouver l'ingrédient secret à temps, l'usine devra fermer. Qui peut bien en vouloir à ce précieux trésor ?
Lily, Marta, Carla et Ella, la narratrice, sont prisonnières du camp de concentration de Birchwood. Ella, âgée de 14 ans et couturière, confectionne les vêtements des officiers. Elle s'accroche à la couture, sa passion, pour retrouver l'espoir.
Madame Grace a été enlevée par les gobelins, alliés fidèles et sans pitié de Mulgarath, un ogre épouvantable. Pour la sauver, Jared, Maloory et Simon doivent réclamer de l'aide à un griffon têtu, un farfadet frondeur, un hobgobelin grognon, des esprits des bois en colère, ainsi qu'à Spiderwick, leur oncle.