Fin XIXe siècle, le père d'Aura Institoris, un alchimiste, est assassiné sur l'ordre de son plus terrible rival Lysander. Celle-ci décide de relever le défi d'affronter le meurtrier de son père qui fomente ses plans dans les catacombes situées sous le palais de la Hofburg à Vienne. S'initiant aux secrets de l'alchimie, elle va braver les intrigues et les dangers.