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Gene et Sissy se retrouvent à la Mission parmi les humains qui ont échappé à la nouvelle race. Gene espère découvrir la trace du Scientifique, se sentant en sécurité au sein de la communauté. Il regrette d'avoir abandonné son premier amour. Mais l'ennemi, au sein de la colonie, n'est pas celui qu'il croit.

Après avoir fui la Mission, Gene et Sissy sont incertains quant à leur destin : ils souhaitent atteindre la civilisation, mais peuvent aussi rejoindre la cité des crépusculaires. Ils doivent trouver le remède qui les transformera en humains pour survivre.

L'un des derniers humains sur Terre, Gene, doit se faire passer pour l'un de ses prédateurs s'il veut survivre. Il vit ainsi secrètement depuis dix-sept ans tout en se créant un semblant de vie normale. Sa vie est menacée lorsqu'il est sélectionné pour participer à un grand jeu : la Traque. Il s'agit d'une grande chasse où seuls quelques privilégiés peuvent pister les derniers survivants humains.