La saison traite d'un incident qui s'est déroulé en 1979 à Sioux Falls, dans le Dakota du Sud, et qui a été plusieurs fois mentionné durant la première saison. Elle met en scène l'esthéticienne Peggy Blomquist et son mari, un boucher du nom d'Ed Blomquist, qui décident de couvrir leurs traces après le meurtre involontaire de Rye Gerhardt, un des fils d'une famille criminelle locale, dont la matriarche est Floyd Gerhardt. Pendant ce temps, Lou Solverson, qui vient de rentrer du Vietnam, et le sherif Hank Larsson enquêtent sur trois meurtres commis par Rye Gerhardt tout en protégeant le candidat républicain aux élections présidentielles Ronald Reagan lors de son arrêt de campagne à Fargo.