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Théodore est un jeune écureuil qui vit dans la Forêt sauvage. Un jour, emporté par une inondation, il échoue dans la Cité des ruines, une ancienne ville d'où les humains ont disparu à la suite d'une catastrophe. Une mystérieuse princesse lézard-dragon vit là en compagnie de ses esclaves et d'une armée de rats. Théodore se réfugie auprès de Fitzgerald, un porc-épic, et d'Olive, un ours.

Théodore et ses amis sont préoccupés : les animaux commencent à commettre les mêmes erreurs que les êtres humains. Ils vont aider Upsilon à se débarasser d'une dragonne et sauver ainsi le mont des brumes.

Au mont des Brumes, les animaux vivent en autarcie depuis que les humains ont disparu. Mais Olive souhaite partir à la recherche de sa soeur Rosa, aussi, à bord du bateau conçu à partir des plans du savant Oscar, Théodore et ses amis, guidés par Oscar, partent en quête de Faravole, une île peuplée uniquement d'oiseaux.