Italie, 1327. Une série de meurtres mystérieux au cœur d'une abbaye bénédictine sème le trouble dans la région isolée du nord des Alpes. Guillaume de Baskerville, assisté de son novice Melk, témoins de ces atrocités, mènent l'enquête. Ils sont eux-mêmes traqués par Bernard Gui, homme de main impitoyable du Pape. Ce dernier n'a qu'un seul objectif : éliminer l'ordre de Saint François, dont Baskerville est membre.