Un arbre qui se dresse sur le parc du château de la Princesse Peach est dépouillé de toutes ses feuilles pendant une tempête. Les feuilles, qui s'avèrent être des Super feuilles, sont soufflées à travers le Royaume Champignon et confèrent des queues de tanuki à tous les êtres vivants qu'elles touchent. Quand Mario et les Toads se dirigent vers l'arbre le lendemain, ils découvrent une lettre de Bowser leur apprenant qu'il a kidnappé la princesse Peach. Mario se lance à sa poursuite afin de le localiser et de sauver la princesse.
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