Egypte ancienne. La jeune Hatchepsout devient reine, en s'unissant à son demi-frère Séthi, Thoutmôsis II. La jeune femme est rongée par la colère car elle ne veut pas être reléguée au second plan, mais souhaite être pharaon elle-même, comme son père. C'est pour elle le début d'un long combat pour changer les conventions ancestrales et devenir la première grande reine de l'histoire.
Alors que Thoutmosis Ier a reçu une blessure fatale, son fils fait de sa vengeance un bain de sang. La reine Hatchepsout, impuissante face à la situation, se lie d'amitié avec un scribe qui l'aide à enquêter sur les intrigues de la cour. Elle espère ainsi mettre un terme au conflit.